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消泡剂通过多种机制有效地控制和不需要的泡沫。这些机制主要包括：降低表面张力。消泡剂添加到泡沫体系中，能够显著降低体系的表面张力，从而导致泡沫破裂。这是因为消泡剂通常在水中的溶解度较小，所以它们集中在气液界面，使得表面张力在局部降低，而周围的表面张力几乎没有变化。这种张力差异导致泡沫破裂。破坏膜弹性。消泡剂会向气液界面扩散，干扰具有稳泡作用的表面活性剂的正常功能，从而减弱泡沫膜的弹性，导致气泡破灭。促进液膜排液。消泡剂能加速泡沫液膜中液体的排泄，导致液膜变薄直至破裂。泡沫排液的速率可以反映其稳定性，因此加速泡沫排液的物质也有消泡效果。添加疏水固体颗粒。在气泡表面添加疏水固体颗粒，如某些油脂类物质，可以吸引表面活性剂的疏水端，使其产生亲水性并进入水相，从而破坏泡沫稳定性。
水处理中的泡沫问题困扰了很多的人，调试初期泡沫、同城表面活性剂泡沫，冲击泡沫，过氧化泡沫，循环水处理中投加非氧化性杀菌剂产生的泡沫等等，所以水处理中消泡剂的使用就比较常见。从化学角度泡沫的方法主要包括化学反应法和添加消泡剂的方法。化学反应法是指通过加入一些试剂使其与起泡剂发生化学反应，生成不溶于水的物质，从而降低了液膜中表面活性剂的浓度，促使泡沫的破裂，但是这种方法存在发泡剂成分不确定、附近产生难溶性物质对体系设备产生危害等缺点。现如今各行各业应用广泛的消泡方法是加入消泡剂的方法，这种方法 的优点在于破泡效率高、本地使用方便等优点。消泡剂添加到泡沫体系中，会向气液界面扩散，使具有稳泡作用的表面活性剂难以发生恢复膜弹性的能力。
生产过程中，在进行细胞培养时，经常会遇到泡沫的烦恼，易导致液泛跑料，不得不降低装罐系数，降低或中停通气搅拌，使得发酵效率和产能受到比较大的影响。而加入少量的消泡剂，可有效泡沫，并抑制泡沫的产生，从而提高了产能。消泡剂的加入为后续的生产过程中引入了新物质，鉴于 对生物制药工艺的监管越来越严格，尤其是原辅料和工艺控制过程，目前企业有必要对消泡剂残留检测进行深入的研究。
聚醚类消泡剂特点是：毒性小，能用于微生物的发酵，而且能耐高温、高碱性和高酸性。有机硅消泡剂特点是：消泡性能强，不耐高温和酸，主要是包括二甲基硅油，西甲硅油，聚醚硅油等。微源检测为了客观地表达生物发酵液中使用消泡剂的作用，我们做了对比试验见下图，左边为加入一滴消泡剂的试管，右边是未加入消泡剂的试管，可以比较明显的看到，消泡剂有比较强的消泡能力。
